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上海達為科生物科技有限公司

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SNP檢測服務
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SNP檢測服務
達為科優勢
  • 我們可利用多套技術方案提供量身定做的個性化服務,包括DNA測序法和MGB探針法。
    1. DNA測序法:該方法原理簡單,容易掌握,適合對短基因片斷的SNP篩查;通過直接測序方法進行SNP檢測的檢出率接近;
    2. MGB探針法:先進的熒光檢測技術,實現多色熒光同時檢測。通量大,速度快;操作簡便:一步PCR反應后,直接上機檢測。適合位點數量少,樣本通量高的檢測(探針合成費用高)。
    3. Multiplex SNaPshot SNP分型法:該技術主要針對中等通量的SNP分型項目。在一個含有測序酶,四種熒光標記的ddNTP,緊挨多態位點5'端的不同長度延伸引物和PCR產物模板的反應體系中,引物延伸一個堿基即終止,經ABI測序儀跑膠后,根據峰的顏色可知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型,根據峰移動的膠位置確定該延伸產物對應的SNP位點。對于PCR產物模板可通過多重PCR反應體系來獲得。該技術跟其它SNP分型技術相比的優勢:分型準確,其準確度僅亞于直接測序;多位點同時檢測(可以同時檢測達12個位點);不受SNP位點多態特性限制,不管該位點是G/C,A/T,G/A,C/T還是插入/缺失多態,都可以放在一個體系中檢測;可以檢測出受污染的樣本。
  • 質量:SNP檢測的檢出率接近。
原理
SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態,是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態。一般來說,一個SNP位點只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發生頻率比較高,大約平均每1000個堿基中就有一個多態位點,是繼微衛星之后的第三代遺傳標記。有些SNP位點還會影響基因的功能,從而導致生物性狀改變甚至致病。SNP廣泛用于群體遺傳學研究(如生物的起源、進化及遷移等方面,將逐漸取代微衛星而成為新一代的分子生物學標記)和**相關基因的研究,在**基因組學、診斷學和生物醫學研究中起重要作用。
服務流程
  1. 測序法
    1. 客戶提供:提供新鮮的且盡量多的材料,或直接提供純化好的基因組DNA;提供已知的全長基因序列;提供盡可能詳細的背景資料。
    2. 引物設計與合成:針對客戶感興趣的DNA區域,我們將為客戶提供包括PCR擴增引物和測序引物在內的所有引物。
    3. PCR服務:包括PCR擴增實驗和PCR產物純化。
    4. 測序服務:我們采用ABI 3730xl 測序儀進行重測序反應。
    5. 數據分析服務:對整個重測序實驗的結果進行初步分析。
    6. 我們提供:峰圖文件(abl.格式),序列文件(seq.格式);數據分析報告。
  2. MGB探針法
    1. 客戶提供:提供新鮮的且盡量多的材料,或直接提供純化好的基因組DNA;提供已知的全長基因序列;提供盡可能詳細的背景資料。
    2. 根據基因序列設計特異性的引物和MGB探針。
    3. 提取DNA/RNA。
    4. 以DNA為模板,對目的基因進行熒光定量PCR檢測分析。
    5. 提供實驗分析結果。
    6. 我們提供:峰圖文件(abl.格式),序列文件(seq.格式);數據分析報告。
  3. Multiplex SNaPshot SNP分型法
    1. 客戶提供:提供新鮮的且盡量多的材料,或直接提供純化好的基因組DNA;提供已知的全長基因序列;提供盡可能詳細的背景資料。
    2. 設計PCR 擴增含SNPs 位點的一段DNA。
    3. 對PCR 產物進行純化(去除引物和dNTP)。
    4. 引物延伸。
    5. 延伸產物檢測。
    6. 我們提供:峰圖文件(abl.格式),序列文件(seq.格式);數據分析報告。

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