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SNP檢測
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SNP檢測 其它品牌

SNP檢測公司,即單核苷酸多態,是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態。廣泛用于群體遺傳學研究,和**相關基因的研究,在**基因組學、診斷學和生物醫學研究中起重要作用。上海達為科生物科技有限公司可利用測序為您提供SNP的分析,該方法原理簡單,容易掌握,適合對短基因片斷的SNP篩查,通過直接測序方法進行SNP檢測的檢出率接近100。

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SNP檢測
SNP
本公司推出多種SNP分型服務的方法:直接測序方法、連接酶檢測反應(LDR)方法、多重SNaPshot SNP方法、MassArray方法以及Taqman探針方法,為廣大客戶提供多樣的選擇!
1.連接酶檢測反應(LDR)分型方法
技術原理:主要應用連接酶檢測反應 (ligase detection reaction,LDR)技術。即在Taq DNA連接酶的作用下,當左右兩條寡核苷酸探針與目的DNA序列互補,并且兩條探針之間沒有空隙時才能發生連接反應,否則連接反應不能進行,后通過熒光掃描片段長度,實現對SNP 位點的檢測。
原理及實驗流程示意圖:
2.多重SNaPshot SNP分型方法
技術原理:SNaPshot SNP分型是一種以單堿基延伸原理為基礎,同時利用多重PCR對多個已知SNP 位點進行遺傳分型的方法。在一個含有測序酶,四種熒光標記的ddNTP,緊挨多態位點5’端的不同長度延伸引物和PCR產物模板的反應體系中,引物延伸一個堿基即終止,經ABI 3730 測序儀跑膠后,根據峰的顏色可知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型,根據峰移動的膠位置確定該延伸產物對應的SNP位點。
原理及實驗流程示意圖:
3.MassArray SNP分型方法
技術原理: Sequenom MassArray系統主要是利用基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜 (MALDI-TOF MS) 進行分析,即PCR擴增產物或者預處理樣本在延伸單堿基后,將制備的樣品分析物與芯片基質共結晶,將該晶體放入質譜儀的真空管,而后用瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發,由于基質分子經輻射吸收能量,導致能量蓄積并迅速產熱,從而使基質晶體升華,核酸分子就會解吸附并轉變為亞穩態離子,產生的離子多為單電荷離子,這些單電荷離子在加速電場中獲得相同的動能,進而在一非電場漂移區內按照其質荷比率得以分離,在真空小管中飛行到達檢測器。
原理及實驗流程示意圖:
4.直接測序法
技術原理:將待檢測片段進行PCR擴增并直接測序是SNP檢測方法中準確的方法。純合位點為單峰,而雜合峰為套峰,因而很容易將幾種基因型區分開來。直接測序法不僅可用于對已知位點的檢測,還可用于發現未知的SNP位點。
原理及實驗流程示意圖:
5.Taqman 探針方法
技術原理:在PCR 反應系統中加入2 種不同熒光標記的探針,它們可分別與2個等位基因配對。正常情況下,由于探針5′端熒光基團和3′端淬滅基團緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR 的有效進行,與模板配對的探針逐步被Taq DNA 聚合酶5′→3′外切酶活性切割,致使探針5′端上的熒光基團與3′端的淬滅基團分離,淬滅效應解除,報告熒光基團被激活;而與模板不能配對的探針(代表另一種等位基因)不能被有效切割,故檢測不到熒光信號,通過相應儀器檢測熒光值的變化即可實現SNP位點檢測。
原理及實驗流程示意圖:

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